临床生化检测系统涉及光学、精密机械、自动控制、电子电路、热工学、生物化学、分析化学等学科，且要求高精度、高可靠性，是一个十分复杂的系统。临床生化检测系统的测量参数分为基本分析参数(或通用参数)和特殊分析参数(也称质量保证参数)，不同种类的分析仪都需要设置基本分析参数，这些参数缺一不可，而特殊分析参数在不同分析仪上差别很大。
一、临床生化检测系统的基本分析参数，主要包括：
1.试验名称：或通道名称，目的是与其他通道相区别，常以项目的英文缩写来表示。
2.方法类型：检测方法类型或分析类型至少分为终点法和速率法两种，其它方法都与这两类方法有关。
3.反应温度：一般有30℃、37℃可供选择，通常固定为37℃。
4.测定波长：后分光技术的分析仪可选择单波长或双波长，个别仪器只能选择双波长。
5.反应方向：有正向反应和负向反应两种。
6.样品量(Sv)：第1试剂量(R1)/第2试剂量(R2)。
7.反应时间：在试剂盒说明书中，终点法会给出反应达到终点的时间，二点法会给出第1次测光点(t1)和第2次测光点(t2)，连续监测法会给出反应需要的延迟时间和线性反应时间。
8.校准参数：分析仪测定方法基本上都需要校准(calibration)，校准类型分为线性校准和非线性校准。
9.线性范围、可报告范围和小数点位数：超过方法的线性范围(linearity range)时应增加样品量或减少样品量重测;有些仪器有检测结果的小数点位数(decimal point digit)设值。小数点位数增加，K值位数也相应增大，在输入K值时应引起注意。
10.参考区间：若测定结果在参考区间之外仪器会有提示。
二、临床生化检测系统的特殊分析参数，主要包括：
试剂空白(吸光度)检查、校准核查、血清指数校正、线性检查、反应限核查、底物耗尽参数、前区/带现象检查、自动稀释参数、尿液参数、防交叉污染参数等。配套与非配套检测系统的差别在于测量程序的好与坏、有与无、算法的强和弱，客户端的表现就是解决临床问题的强弱、解决异常标本检测结果准确性的能力。
三、临床生化检测系统的测量程序分析参数的验证与固化：
配套检测系统无论是基本分析参数还是特殊分析参数，厂商均经过反复验证和全性能确认，形成固定组合，固化于分析仪的计算机中。
国内仅生产试剂的厂商没有办法做到每种试剂在所有机型都有充分验证的分析参数，同时，实验室对自建检测系统测量程序分析参数的设置很难做到反复验证和全性能确认，因此，自建检测系统对分析测量范围以外的检验结果或者特殊样本的检验结果很难有质量保证，往往引起临床后果时才被发现。
临床生化检测系统，它是通过对血液或者其他体液的分析来测定各种生化指标：如转氨酶、血红蛋白、白蛋白、总蛋白、胆固醇、肌肝、葡萄糖、无机磷、淀粉酶、钙等。结合其他临床资料进行综合分析，可以帮助诊断疾病，对器官功能做出评价，鉴别并发因子，以及决定今后治疗的基准等。
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