我们的牙根是埋在牙槽骨和牙周膜里面的，就像树根扎根在土壤中一样，肉眼是看不到的。因此，如果牙齿出了问题，就需要有“透视”功能的X光来检查。
但是传统的牙片机、全景机都是二维的，对一般的牙根炎症、牙体折裂、骨质状况等情况可以得到较好的反映。但由于这些设备只能从一个固定的方向上进行投照，有些病变由于组织的重合不易被发现，而对于一些严重或复杂的疾病，必须观察到病变、神经及组织的相邻关系才能够进行准确的治疗。这就很容易因二维平面影像重叠导致医生误判，使诊断受限，再加上如果医生技术不纯熟，在手术治疗中很可能会不慎破坏患者的神经、鼻窦，甚至导致颜面神经麻痹、鼻窦炎等。
而口腔种植手术的成功率与患者牙床的骨密度、牙槽骨本身高度、宽度等条件息息相关。在种植牙前利用口腔CT对患者的牙床进行检查，可以判断牙槽骨的宽度、厚度及高度、骨的密度、重要的颜面神经、鼻窦位置等。医生不仅可以直观的看到牙槽骨的立体影像，还可以切换不同的视角来观察软、硬组织之间的位置关系，在手术方案中避开危险区域，保证手术的安全性。除此之外，医生还可以利用口腔CT数据进行数字模型重建，配合软件预先做好手术模板，使种植手术更安全快捷，降低手术风险。
除了口腔种植外，口腔CT还可以用于多生牙、阻生牙检查、口腔颌面部囊肿、牙体牙髓及牙周检查、根充检查、颞下颌关节检查等多种口腔治疗，它是一种专为牙科使用而设计的影像设备，以更低的辐射剂量和更高的分辨率成为近年来CT在口腔医学领域的重要应用。
